La seguridad es el criterio primordial que se ha tenido en cuenta en la planificación, desarrollo y ejecución del Metropolitano de Granada. Tanto en el diseño de los trenes, paradas y estaciones, como en la confluencia con peatones y otros medios de transporte públicos y privados, se han seguido los más estrictos criterios y protocolos en seguridad vial.

El diseño arquitectónico de las estaciones destaca por la ausencia de recovecos y zonas oscuras, primando amplios espacios con plena visibilidad desde cualquier punto de la estación. Las estaciones, paradas y unidades estarán dotadas de los dispositivos tecnológicos necesarios (cámaras de video-vigilancia, megafonía, etc.) para garantizar la seguridad de los usuarios. Asimismo, un importante equipo humano garantizará la vigilancia en todas las estaciones y paradas.

Tanto los medios técnicos como humanos estarán supervisados desde un Puesto de Mando Centralizado que permitirá un control del tráfico de las unidades y del resto de sistemas generales: vigilancia y seguridad en estaciones, coches e infraestructuras, instalaciones contra incendios, escaleras mecánicas, puertas de accesos, etc.

A su vez, para garantizar la compatibilidad con otros vehículos y la eficiencia del servicio (en frecuencias y tiempos de viaje), la plataforma del Metropolitano de Granada estará totalmente segregada del tráfico rodado, salvo en los cruces en superficie con el tráfico privado, donde existirá regulación semafórica con prioridad para el metro ligero.